研究中MSI检测使用了上海普洛麦格生物产品有限公司生产的微卫星不稳定性（MSI）检测试剂盒（荧光PCR-毛细管电泳法）进行MSI检测。检测位点包括8个微卫星位点（NR-21、BAT-25、BAT-26、Mono-27、BAT-52、BAT-56、BAT-59、BAT-60），通过荧光PCR-毛细管电泳的方法对8个微卫星位点进行扩增以及比对正常组织与癌症组织中每个位点片段大小的变化来确定微卫星不稳定性。当癌组织微卫星片段大小与正常组织比较有≥3 pb 的差异，该微卫星位点不稳定。统计所有微卫星位点结果，当有≥2个微卫星位点不稳定，该癌组织样本判读为MSI-H；当只有1个微卫星位点不稳定，该癌组织样本判读为MSI-L；当没有微卫星位点不稳定，该癌组织样本判读为MSS。

文章中的研究对106 例dMMR病例和193 例pMMR病例（包含46 例肿瘤细胞呈异质性表达的病例）进行了PCR-毛细管电泳法检测，发现IHC方法和PCR-毛细管电泳法检测方法结果不一致的病例有14例，我们对这14例标本选用了另一家公司抗体重做了4项MMR蛋白免疫组化并重新检测了其MSI状态，最终确定两种方法不一致的病例为4 例（表3）。文章分析了两种方法第一次检测结果有误的10 例样本，造成检测有误的原因主要有4种（表4）：免疫组化染色弱导致误判为dMMR，免疫组化背景高导致误判为pMMR，标本污染导致PCR-CE结果为MSI-H，肿瘤细胞少导致PCR-CE结果为MSS。最终结果证实为MSI-H的有106例，MSI-L的有22例，MSS的有171例。最后通过对免疫组化和PCR-毛细管电泳法检测结果的比较，发现两者差异没有统计学意义（P=1.000），295例检测结果一致，两种方法检测结果的符合率为98.7%（表5）；46例肿瘤细胞呈异质性表达的pMMR病例中，PCR-毛细管电泳法检测结果为MSS或者MSI-L的有44例，检测结果为MSI-H的有2例。

最终文章的讨论部分提到，研究证实MSI多由MMR蛋白表达缺失所致。因此，可通过检测MMR蛋白或MSI来反映微卫星状态。通过IHC法检测MMR蛋白和通过PCR法检测MSI是评估相同生物学效应的不同检测方法。IHC 法检测MMR蛋白是一种间接评估微卫星状态的方法。直接检测MSI状态的常用方法是多重荧光PCR毛细血管电泳法，这也是目前认可的金标准。作者通过对免疫组化和PCR-毛细管电泳法检测结果的分析发现两种方法对MSI的检出率显示高度的一致性，符合率达到98.7%，高于国内报道的95%左右。研究实验采用的ProDx^® 微卫星不稳定性（MSI）检测试剂盒含长单核苷酸重复位点, 长单核苷酸重复位点有更长的位移,具有高突变频率和高检测灵敏度。