Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒可从多种FFPE组织类型(包括具有挑战性的样本)中最大化回收高质量、可扩增且完整性高的DNA和RNA
DNA和RNA适用于要求严苛的下游分子应用,如NGS、数字PCR等,为诊断和临床研究工作流程提供更高的灵敏度和信心。
条形图比较了来自多种FFPE组织样本的DNA产量(Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒与两款竞品),并通过短靶标扩增子扩增进行评估。
使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒在多种FFPE组织类型中实现高产率、高质量的DNA和RNA提取。使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA依次提取工作流程或两款其他手动试剂盒并按照制造商方案,从每种指定FFPE人体组织类型的单张切片中提取DNA和RNA。DNA产量通过靶向150bp(图A)和300bp(图B)扩增子的qPCR进行评估。RNA产量通过靶向100bp(图C)和171bp(图D)扩增子的RT-qPCR进行测量。在所有FFPE组织类型中,Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒均提供了相当或更高的DNA和RNA产量,尤其是对于较长的扩增子,这证明了其稳健的性能以及在从具有挑战性的FFPE组织样本中回收高质量、可扩增核酸方面的有效性。数据代表平均值±标准差,N=6。
凝胶照片比较了来自几种提取试剂盒(Maxwell
® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒与两款竞品)的FFPE DNA和RNA片段大小与质量;DNA片段大小使用Agilent TapeStation检测进行评估。
使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒从FFPE组织中获取更优异的DNA和RNA片段质量。使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA依次提取工作流程和另外两款替代FFPE DNA/RNA试剂盒,从FFPE人乳腺组织的单张切片中提取DNA和RNA。片段质量使用TapeStation分析进行评估。图A. DNA片段质量使用Agilent D5000 ScreenTape检测进行评估。图B. RNA片段质量和DV200值使用Agilent RNA ScreenTape检测进行评估。这些结果表明,与完整性较低且DNA和RNA片段化增加的竞品试剂盒相比,Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒可产出高质量、完整的DNA和RNA,且完整性更高。
使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒从FFPE组织样本中提取的DNA和RNA具有高质量和可扩增性,能够在临床和转化工作流程中实现灵敏且可靠的基因表达或突变分析。
散点图展示了Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒在数字PCR中的性能。
使用从FFPE组织中提取的RNA通过数字PCR检测致癌变异。使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA依次提取工作流程从不同FFPE人肺肿瘤组织样本中提取RNA,并使用针对EML4-ALK mRNA融合的微滴数字PCR检测进行分析。具有代表性的二维振幅散点图显示了左上象限中明显的液滴簇(蓝色圆圈标记为“阳性”),表明目标基因融合变异被成功扩增。阴性液滴集中在基线附近,证实了强信号分离和检测特异性。
DNA和RNA兼容下一代测序(NGS)。使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA依次提取工作流程(XtractAll)或竞品FFPE DNA/RNA提取试剂盒(竞品Q),从FFPE人乳腺和肺肿瘤组织的单张切片中提取DNA和RNA。纯化的DNA和RNA样本使用TruSight Oncology 500(TSO 500)检测(Illumina)进行分析。所有样本均成功完成文库制备,并在NovaSeq PE150平台(Illumina)上进行测序,每个样本产生8000万总reads(4000万双端reads),覆盖深度为35,000X。展示了使用Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒与竞品Q从指定FFPE组织样本中提取的DNA和RNA的关键质量控制及NGS性能指标。与竞品Q相比,Maxwell® CSC XtractAll FFPE DNA/RNA试剂盒产出的DNA和RNA具有更高的完整性和更长的片段长度,表现出更好的靶标覆盖度。